한 번의 이동은 Boltzmann 확률로 결정됩니다.
잔기 하나를 무작위로 이동한 뒤 에너지 변화 ΔE를 계산합니다. 에너지가 낮아지면 이동을 받아들이고, 높아지더라도 P = exp(−ΔE/T)의 확률로 수용합니다. 이 규칙이 국소 최소점 탈출과 열적 요동을 만듭니다.
Ebond연속 잔기의 결합 길이를 유지하는 조화 퍼텐셜
Ebend사슬의 급격한 굽힘에 드는 에너지
Enonbond소수성·극성·전하·시스테인 접촉의 축약 상호작용
Esolvent물·변성제·막 환경이 잔기 배치에 주는 선택 압력